Nouvelle étude majeure sur les basidiomycètes
Posté : 29 nov. 2019, 09:44
Bonjour à tous,
Il y a quelques jours, une étude très importante pour la classification des basidiomycètes a été publiée. Elle marque en quelque sorte un nouveau départ comme l'ont fait les classifications APG chez les plantes. Bien que complexe à appréhender pour la plupart des mycologues, je conseille vivement de la lire, au moins partiellement. Difficile de la résumer mieux qu'en traduisant son abstract, donc le voici :
Il y a quelques jours, une étude très importante pour la classification des basidiomycètes a été publiée. Elle marque en quelque sorte un nouveau départ comme l'ont fait les classifications APG chez les plantes. Bien que complexe à appréhender pour la plupart des mycologues, je conseille vivement de la lire, au moins partiellement. Difficile de la résumer mieux qu'en traduisant son abstract, donc le voici :
Les basidiomycètes constituent un phylum majeur du royaume Fungi et est le deuxième en terme de nombre d'espèces, se situant directement derrière les ascomycètes. Le travail présent fournit une vue d'ensemble de tous les genres validement publiés et actuellement utilisés chez les basidiomycètes dans une seul document. Un contour de tous les genres de basidiomycètes est fournit, incluant 1928 noms de genres actuellement utilisés avec 1263 synonymes, distribués dans 241 familles, 68 ordres, 18 classes et 4 subphyla. Nous fournissons de brèves notes pour chaque genre accepté, incluant des informations sur la classification, le nombre d'espèces acceptées, l'espèce type, le mode de vie, l'habitat, la distribution et des informations sur les séquences. De plus, trois analyses phylogénétiques avec la combinaison des sets de données de marqueurs LSU, SSU, 5.8s, rpb1, rpb2 et ef1 pour les subphyla Agaricomycotina, Pucciniomycotina et Ustilagomycotina ont été respectivement conduites. Des temps de divergence génétiques estimés au niveau familial avec 632 espèces de 62 ordres, 168 familles et 605 genres. Notre étude indique que le temps de de divergence des subphyla des Basidiomycota sont de 406-430 millions d'années, des classes de 211-383 millions d'années et les ordres de 99-323 millions d'années, lesquelles sont largement consistantes avec les études précédentes. Dans cette étude, toutes les familles phylogénétiquement supportées ont été datées, avec les familles d'Agaricomycotina divergeant de 21-278 millions d'années, celles de Pucciniomycotina de 85-222 millions d'années et celles d'Ustilagomycotina de 79-177 millions d'années. Les temps de divergence en tant que critère additionnel dans la classification fournit des preuves additionnelles pour résoudre des problèmes taxinomiques dans le système taxinomique des Basidiomycotina et permettent également une meilleure compréhension de leur phylogénie et évolution.He, MQ., Zhao, RL., Hyde, K.D. et al. Fungal Diversity (2019). https://doi.org/10.1007/s13225-019-00435-4