Pour l'aspect, je suppose que les périthèces sont plus grosses car ce sont des sortes d'apothécies fermées par une espèce de chapeau percé d'un trou pour laisser passer les spores. Pour la nature même de ces formations, la différence a quelque chose à voir avec le cycle de reproduction des ascomycètes qui est un peu compliqué.
En gros, l'apothécie est le lieu de la reproduction sexuée : les noyaux haploïdes fusionnent, les cellules diploïdes qui en résultent produisent des asques où se déroule illico une réduction chromatique pour donner des spores haploïdes après brassage génétique. Ces spores haploïdes produiront les filaments mycéliens qui, chez les lichens, englobent les algues dans le cortex et constituent la totalité de la médulle.
Il arrive que ces filaments mycéliens s'organisent en structures de reproduction non sexuée, émettant des conidiospores : chez les lichens, les pycnides sont ces structures de reproduction végétative.
J'espère n'avoir été ni trop lapidaire (le cycle de reproduction haplodiplophasique en cinq lignes, je n'avais jamais encore essayé), ni trop lourde (sur le terrain on s'en fiche un peu, de savoir d'où proviennent les noyaux des filaments mycéliens) ... mais l'important c'est de participer, non ? 😜