Bonsoir,
A mon avis, l'idéal pour mesurer des spores, c'est de pouvoir prendre des photos sur son microscope. Ensuite, il faut une lame étalonnée. Cela permet de faire la correspondance nombre de pixels / distance en micromètres.
Vous pouvez étalonner avec un logiciel comme piximètre (http://ach.log.free.fr/Piximetre/) ou mycomètre (http://mycolim.free.fr/DOC_SML/mycm202/Charg_Mycm202.htm). L'étalonnage peut être fait pour chaque objectif. Ensuite, on prend la photo, on l'importe dans le logiciel et on peut directement mesurer et tous les calculs (moyennes, courbe de gauss, extrêmes, ...) sont faits automatiquement...
L'autre solution, c'est d'utiliser un oculaire gradué.