Bonjour Thomas.
En attendant de laisser Laurent t'apporter une réponse beaucoup plus complète et beaucoup plus expérimentée que la mienne, voici quelques éléments.
Tout d'abord, il existe des applications plus complètes que celles du téléphone, par exemple Lightroom pour mobile qui propose de l'édition mais aussi et surtout un module d'appareil photo avec des réglages assez faciles d'accès (exposition, balance des blancs, vitesse d'obturation, etc.).
Il faut ensuite apprendre les principes de la photo : j'ai appris beaucoup depuis que j'ai investi dans un appareil photo et les principes valent aussi pour les téléphones.
Le flou peut avoir plusieurs origines :
- le mouvement du sujet (ici exclu)
- le mouvement du photographe pendant la prise de vue
- la profondeur de champ, c'est à dire la zone de netteté.
Je pense que c'est ce dernier cas de figure qui te concerne : la photo est nette sur le spécimen sur lequel tu fais la focalisation, mais pas sur le reste, si j'ai bien compris. J'ai eu le même problème cet automne, avant d'investir et d'apprendre à utiliser les réglages. Avec le recul, je comprends les erreurs que je faisais.
Avec un smartphone, la solution la plus simple est de s'éloigner des sujets à photographier : cela étendra la zone de netteté, mais il faudra ensuite rogner l'image (et donc perdre un peu en qualité, plus ou moins en fonction de l'appareil).
Pour améliorer la qualité des photos en basse lumière, il faut aussi utiliser un trépied (pour smartphone, il en existe de vraiment abordables). En effet, autant en pleine lumière, il ne lui faut qu'une fraction de seconde pour prendre une photographie car beaucoup de lumière atteint le capteur en un rien de temps, autant en basse luminosité, il faut plus longtemps à l'appareil pour capter une quantité équivalente de lumière. Cela allonge le temps de pose, ce qui fait que le moindre mouvement imperceptible de la main va se voir sur le résultat. Avec un trépied, ce n'est plus un problème : l'appareil peut prendre son temps sans dégrader la qualité (et sans rentrer dans les détails, sauf si tu veux en savoir davantage, cela te permet de régler les ISO au minimum car des ISO élevés réduisent la qualité de la photo). Pour te donner un exemple parlant, mon appareil photo (un hybride), selon les réglages, peut mettre 30 secondes à faire un photo ! Ce ne sera pas le cas avec un téléphone, mais c'est pour bien illustrer l'importance de ce paramètre.
En ce qui concerne la coloration de tes photos, c'est l'effet de la "balance des blancs", bien expliquée par Laurent sur son site : la lumière du plein soleil n'a pas la même "température" que celle d'un ciel nuageux ou d'une lampe d'intérieur. Il faut donc choisir le réglage adapté au moment où tu prends ta photo : le téléphone ajoutera du bleu si la lumière est trop jaune et vice-versa, pour un rendu plus naturel.
Tout cela semble fastidieux au départ quand on veut se concentrer sur la mycologie, mais c'est vraiment intéressant à apprendre et gratifiant à mettre en œuvre : j'attends avec impatience les premiers champignons pour tester mon premier véritable appareil !