La disparition du "y" est d'origine (1818), pourtant on ne trouve pas cette orthographe avec un "i" dans les dictionnaires latins, et encore moins dans les grecs : le dieu en question s'écrit Ζέφυρος, avec un upsilon, pas un iota.
Alors pour l'instant aucune explication, sauf peut-être encore le vent.
Jplm