Bonjour
c'est le terme "Vaginatae" qui me semble inapproprié car il semble désigner unité de classification (tribu) alors que c'est d'un "groupe-espèce" dont il est question (si j'ai bien compris).
C'est assez courant en zoologie. Les glaciations quaternaires ayant engendrées des isolats de courte durée dont les populations se recombinent puis s'isolent à nouveau, et ainsi de suite... donnant lieu à un sacré foutoir dans certains cas, et poussant les taxonomistes à multiplier les taxons ou à les simplifier selon leur approche fixiste ou dynamique. (La classification linéenne est fixiste par essence).
J'ignore la terminologie en vigueur dans les autres règnes.
L'approche associative par la mycorhize me semble intéressante même si elle n'implique pas automatiquement la spéciation, mais plutôt une morphologie adaptative.